汽修专业考研中，最难的科目通常包括以下几门：
1. 机械原理与设计：涉及复杂的机械理论，要求考生有扎实的物理和数学基础。
2. 汽车电子技术：涉及现代汽车电子系统的知识，对电子和计算机技术的要求较高。
3. 汽车发动机原理：内容繁杂，需要深入理解发动机的工作原理和结构。
4. 汽车维修技术：实践性较强，要求考生不仅要有理论知识，还要具备一定的动手能力。
这些科目不仅考察理论知识的掌握程度，还要求考生能够将理论知识应用于实际问题解决中。
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