吉林地区考研难度较高的院校主要包括：
1. 吉林大学：作为国家“双一流”建设高校，吉林大学在多个学科领域都有很高的学术地位，考研竞争激烈。
2. 东北师范大学：以师范教育著称，学科实力雄厚，尤其是教育学、心理学等学科在全国有很高的声誉。
3. 长春理工大学：以工学为主，在光学工程、材料科学与工程等领域具有较强的科研实力。
4. 吉林农业大学：在农业科学、植物保护等领域有显著优势，考研难度较高。
5. 吉林财经大学：在经济学、管理学等领域具有较高的学术地位，考研竞争较为激烈。
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