大专药学毕业生在考研时，可以选择以下几所院校进行深造：
1. 北京大学药学院
2. 上海交通大学药学院
3. 浙江大学药学院
4. 华中科技大学同济医学院药学院
5. 中国药科大学
6. 四川大学华西药学院
7. 中国人民解放军医学院药学系
8. 天津医科大学药学院
9. 南京医科大学药学院
10. 沈阳药科大学
以上院校在药学领域具有较高的教学和研究水平，为药学研究生提供了良好的学术氛围和科研条件。当然，选择院校时还需综合考虑个人兴趣、专业方向以及未来职业规划。
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