昌吉地区考研热门学校推荐如下：
1. 新疆大学昌吉校区：作为新疆地区知名的高等学府，其科研实力和教育资源丰富，尤其在理工科领域享有盛誉。
2. 石河子大学：这所大学位于昌吉附近，以农业科学、工程技术等学科为特色，考研竞争激烈。
3. 新疆农业大学昌吉校区：该校以农业学科为主，同时涉及理工科、文科等领域，考研氛围浓厚。
4. 新疆医科大学昌吉校区：医学专业是该校区的一大亮点，对于有意向从事医疗行业的学生来说，是个不错的选择。
5. 昌吉学院：作为一所综合性学院，该校在文科、理科、工科等领域都有一定的实力。
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