民办本科考研的限制主要体现在以下几个方面：
1. 录取政策限制：一些名校或热门专业可能对民办本科学生有额外的录取限制，如成绩要求更高、复试难度加大等。
2. 专业选择限制：部分专业或研究方向的招生计划中，可能对民办本科学生有一定的比例限制。
3. 奖学金和助学金限制：民办本科学生在申请奖学金和助学金时，可能面临更多的竞争压力。
4. 推免资格限制：部分院校可能对民办本科学生申请推免研究生有一定的限制。
5. 学历认可度限制：虽然民办本科学历得到国家认可，但在就业市场上可能面临一定程度的学历歧视。
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