日本考研冷门理科专业包括但不限于以下几种：生物技术、环境科学、食品工程、生物医学工程、纳米技术、材料科学、地质学、海洋学、能源工程、核工程、光学工程等。这些专业由于研究方向较为狭窄，或者市场需求相对较少，因此在日本考研中相对冷门。选择这些专业，学生可以享受更为深入的学术研究机会，同时也能在竞争相对较小的环境中脱颖而出。
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