日语药学考研的院校主要集中在以下几所：
1. 北京大学
2. 上海交通大学
3. 东京大学（日本）
4. 北京外国语大学
5. 南京医科大学
6. 四川大学
7. 武汉大学
8. 中国药科大学
9. 哈尔滨医科大学
10. 中山大学
这些院校在药学领域具有较高的教学和研究水平，尤其是北京大学和上海交通大学，更是国内药学教育的佼佼者。同时，东京大学作为日本的顶尖学府，其药学专业也享有盛誉。
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