日本留学考研通常包括以下科目：
1. 专业基础课程：根据申请的专业不同，可能需要准备的专业基础课程包括数学、物理、化学、生物学等。
2. 日本语能力测试：大多数日本大学要求非日语母语的国际学生参加日本语能力测试（JLPT），以证明其日语水平。
3. 专业课程：申请者需准备与所申请专业相关的课程，如经济学专业的学生可能需要准备经济学理论、统计学等。
4. 研究计划书：详细阐述研究目标、研究方法、预期成果等。
5. 推荐信：由熟悉申请者学术背景和能力的教授或工作单位领导出具。
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