深圳市内负责考研监督的主要机构包括：
1. 深圳市招生考试办公室：负责组织实施深圳市的考研报名、考试等工作，确保考研过程的公平、公正。
2. 深圳市教育考试院：作为市政府直属的专门负责教育考试的机构，负责全市各类教育考试的监督和管理，包括考研。
3. 深圳大学招生办公室：作为深圳市内高校之一，深圳大学招生办公室也参与考研的报名、审核和录取等工作。
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