考研生态学中，最难科目通常包括以下几门：
1. 生态学基础理论：涉及生态学的基本概念、原理和理论框架，需要考生具备扎实的生态学知识基础。
2. 生态统计学：涉及生态数据的收集、处理和分析，对数学和统计学知识要求较高。
3. 生态模型与模拟：要求考生掌握生态模型的基本原理和模拟方法，能够运用模型解决实际问题。
4. 生态保护与恢复：涉及生态保护政策、生态恢复技术和实践应用，要求考生具备一定的实践经验和政策理解能力。
5. 生态经济学：结合经济学原理，研究生态与经济的关系，对经济学和生态学知识都有较高要求。
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